Les objectifs
pédagogiques de la formation de niveau 1
Version
du 4/09/2002
Objectifs
généraux
L'interne est un praticien
en formation qui effectue, dans le cadre de ses fonctions hospitalières, une
activité de biologiste sous la responsabilité d'un biologiste senior au sein
d'un service agréé.
Le niveau 1, qui
correspond aux quatre premiers semestres de l'internat, doit apporter aux
internes les bases de la démarche biologique aussi bien que l'apprentissage, spécialité par spécialité,
de la réalisation des examens les plus couramment pratiqués.
A l'issue de ces quatre semestres, les
internes doivent avoir acquis non seulement une compétence dans le domaine
analytique et méthodologique, mais aussi les connaissances métaboliques,
physiologiques et épidémiologiques permettant de comprendre la pathologie, donc
le fondement des explorations biologiques.
Pour toutes les disciplines, les internes doivent être aptes à instaurer un
dialogue bioclinique, et à exprimer une approche critique sur la cohérence de
la prescription et des résultats biologiques par rapport à l'ensemble du
dossier clinico-biologique.
Ils doivent être ainsi capables de
commenter les résultats et de les valider biologiquement, en vue d'apporter une
aide à la prévention, au diagnostic et au suivi des principales affections, et
de participer efficacement aux stratégies décisionnelles diagnostiques,
thérapeutiques et prophylactiques.
Leur action doit prendre en compte les
aspects médico-légaux de la profession et s'inscrire dans le cadre des règles
d'éthique indispensables à la prise en charge des patients.
Les internes doivent connaître et savoir
appliquer les dispositions réglementaires, et notamment les règles du Guide de
Bonne Exécution des Analyses de Biologie Médicale. Ils doivent en particulier :
§
connaître
les conditions de prélèvement garantissant la sécurité du patient et la qualité
des échantillons à analyser, leur conservation ; connaître les conditions
d'utilisation des différents milieux biologiques, ainsi que les précautions à
respecter pour éviter les risques de contamination du personnel et de
l'environnement, en appliquant les règles d'hygiène en vigueur ;
§
connaître
la pratique des techniques et les principes de base des appareillages les plus
couramment utilisés et savoir choisir les systèmes analytiques appropriés ;
§
gérer les
contrôles de qualité interne et externe selon les contraintes liées à chacune
des différentes spécialités de la biologie ;
§
savoir
gérer les prescriptions, en étant notamment capables de maîtriser le degré
d'urgence d'une demande d'analyses biologiques, ainsi que la mise en place et
le suivi d'activités de biologie délocalisée ; connaître les conséquences des
délais de réponse sur les prises de décision médicale ;
§
connaître
les éléments de statistique indispensables à l'exercice de la profession.
La formation aux recueils d'échantillons
biologiques doit être assurée dans chaque spécialité. Elle doit obligatoirement
comporter les gestes qui permettront au futur biologiste d'être en mesure de
réaliser les prélèvements dans toutes les situations exigées en pratique
courante : prélèvements veineux, artériels, capillaires ; prélèvements chez
l'enfant ; temps de saignement d'Ivy ;
autres prélèvements, prélèvements spécifiques de bactériologie, mycologie et
parasitologie ; ponction de moelle en cas d'exercice hospitalier ; ponction de
ganglion, tubages gastriques, tests fonctionnels.
La mission de formation
des services agréés pour le niveau 1 sera structurée autour des points suivants
:
§
un projet
pédagogique élaboré par le service indiquant les objectifs, les moyens mis à
disposition et les critères de validation des acquis ;
§
des séances
de bibliographie, d'enseignement et/ou de présentation de cas
clinico-biologiques, organisées plusieurs fois par mois ;
§
des
biologistes seniors disponibles en nombre suffisant pour superviser l'activité
des internes ;
§
une
activité comportant l'ensemble des examens les plus courants de la spécialité ;
§
l'organisation
d'une formation aux prélèvements pour les examens de la spécialité ;
§
la participation
à la garde de biologie.
Chaque service pourra être agréé dans
l'une des spécialités suivantes pour le niveau 1 :
§
bactériologie,
virologie et hygiène
§
biochimie
§
hématologie
§
immunologie
§
parasitologie-mycologie
L'agrément pour le niveau
1 n'exclut pas un agrément de niveau 2 pour une formation spécialisée.
Dans chaque spécialité, l'interne devra
satisfaire aux objectifs pédagogiques pour obtenir la validation. Le
coordonnateur inter-régional, assisté du comité pédagogique, définira
les modalités de contrôle des connaissances en fonction des modalités
pédagogiques adoptées et vérifiera [B1]l'adéquation du document de validation
mentionné à l'article 6 du décret fixant la réglementation du DES de biologie
médicale avec ces objectifs.
Objectifs
spécifiques
Bactériologie, virologie et
hygiène
Les objectifs sont classés en
trois modules :
§
bactériologie,
§
virologie,
§
hygiène
Le premier chapitre de
chacun des modules bactériologie et virologie relève d'un enseignement formel.
Les connaissances des autres chapitres,
étant appliquées à l’exercice professionnel, doivent s'intégrer à la pratique
lors des stages dans les services de bactériologie-virologie-hygiène
hospitalo-universitaires. La délivrance des connaissances, théoriques et
pratiques, peut revêtir différentes modalités pédagogiques :
§ cours magistraux, synthèses par un enseignant ou par un étudiant sous la responsabilité d'un enseignant,
§ expertise des résultats des analyses biologiques (cas démonstratifs, pièges d’interprétation…),
§
présentations de cas clinico-biologiques,
§ élaboration d’algorithmes décisionnels,
§ évaluation de stratégies diagnostiques et thérapeutiques,
§ synthèses techniques (réactifs, automates, méthodes de diagnostic…) sous forme de présentation ou d’analyse d’articles.
Ces objectifs seront assortis d’une liste des actes dont le biologiste en formation devra avoir acquis la maîtrise et qui sera validée par les responsables de stage.
Ces objectifs devront faire l'objet d'une réactualisation régulière.
Divers ouvrages doivent être utilisés en référence : conférences de consensus, documents et recommandations des sociétés savantes.
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Module Bactériologie
A. Approfondir les connaissances acquises au
cours du second cycle et nécessaires à la compréhension de la démarche
diagnostique et des principes des tests et/ou analyses utilisés en
bactériologie médicale et concernant notamment :
§
l'anatomie
fonctionnelle des bactéries
§
les
antigènes et les vaccins bactériens
§
les gènes
bactériens et les mécanismes de la variabilité génétique
§
les
principaux facteurs et mécanismes de la virulence bactérienne
§
les
méthodes phénotypiques, moléculaires et sérologiques appliquées au diagnostic.
B. Connaître les mécanismes d'action des antibiotiques, les mécanismes de résistance des bactéries, l'évolution de la résistance et les techniques phénotypiques et moléculaires mises en œuvre au laboratoire pour l'aide à la prescription et au suivi du traitement antibiotique.
C. Connaître les principales bactéries d'intérêt médical et, pour chacune d'elles, approfondir en particulier :
§
la position
taxonomique
§
les
principaux caractères bactériologiques
§
l'habitat
§
l'épidémiologie
§
le pouvoir
pathogène
§
les
principaux facteurs de virulence et leur mécanisme d'action
§
les
prélèvements à effectuer et les conditions de transport des échantillons à
analyser
§
les
éléments du diagnostic bactériologique direct et indirect
§
la
sensibilité et la résistance aux antibiotiques
§
les
principes du traitement prophylactique et curatif
Bactéries à Gram positif :
Staphylococcus
aureus ; Staphylocoques
à coagulase négative ; Streptocoques b-hémolytiques et non groupables ; Streptococcus pneumoniae ; Enterococcus
; Listeria monocytogenes ; Corynebactéries
; Bacillus anthracis ; Clostridium
difficile ; Clostridium perfringens ; Clostridium botulinum.
Bactéries à Gram négatif :
Neisseria meningitidis ; Neisseria gonorrhoeae ; Moraxella ; Escherichia coli et autres
entérobactéries ; Salmonella enterica ; Shigella
; Yersinia ; Pseudomonas aeruginosa ; Acinetobacter
; Vibrio cholerae ; Campylobacter ;
Helicobacter ; Brucella ; Haemophilus
influenzae ; Bordetella pertussis.
Legionella ; Pasteurella
multocida ; Bacteroïdes et bactéries apparentées.
Autres bactéries :
Leptospires ; Treponema
pallidum ; Borrelia burgdorferi ; Mycoplasma-ureaplasma ; Chlamydia ;
Rickettsia ; Mycobacterium tuberculosis ;
Mycobactéries atypiques.
D. Dans la mise en œuvre des examens nécessaires aux diagnostics des septicémies et endocardites, des infections méningées et cérébro-méningées, respiratoires hautes et basses, cutanéo-muqueuses, ostéo-articulaires et viscérales, digestives, urinaires, sexuellement transmissibles et néonatales, connaître en particulier :
§
la validation du contrôle de la
prescription
§
la pratique
de la technique
§
la
gestion des erreurs techniques
§
la
validation biologique
§
la
validation médicale
§
L'assurance
qualité et les obligations réglementaires : GBEA, nomenclature, etc.
§
les risques
professionnels et aspects médico-légaux
(A l'attention des
bactériologistes : Franchement, si vous vous donnez la peine de lire les objectifs
généraux, ceci est en grande partie déjà explicité. Désirez-vous à tout prix
maintenir ce paragraphe [B2]?)
ã
ModuleVirologie
A. Approfondir les connaissances acquises au cours du second cycle et nécessaires à la compréhension de la démarche diagnostique et des principes des analyses et tests utilisés en virologie médicale et concernant notamment :
§
la
structure et l’organisation génétique des virus, viroïdes et agents non
conventionnels
§
le cycle de
réplication des virus et les cibles du traitement antiviral
§
les
mécanismes de la variabilité des virus
§
les
différents modes d’interaction entre le virus et la cellule-hôte
§
les
modalités de transmission des virus et les mécanismes de défense de l’organisme
§
les
facteurs liés au virus et à l’hôte dans la pathogénie des maladies virales et
les différents modes évolutifs de ces dernières
§
les
méthodes de diagnostic direct et indirect des infections virales
§
les
différents types de vaccins antiviraux
§
les
principes de la thérapie génique
B. Connaître les mécanismes d’action et les spectres d’activité des traitements antiviraux, les modalités de résistance des virus et les techniques phénotypiques et génotypiques utilisées pour le suivi des traitements antiviraux
C. Connaître les principaux
virus d’intérêt médical
Pour chacun des virus de la liste ci-dessous, connaître :
§
la position
taxonomique
§
les
principaux caractères virologiques (taille, type d’acide nucléique, symétrie de
la capside, présence ou non d’une enveloppe …)
§
la
constitution antigénique
§
l'épidémiologie
§
le pouvoir
pathogène et la pathogénicité
§
les
éléments du diagnostic virologique direct et indirect
§
le
traitement prophylactique et curatif éventuel
·
Virus à
ADN : adénovirus, Herpesviridae,
virus de l’hépatite B.
·
Virus à
ARN : virus de l’hépatite A, virus de l’hépatite C, virus de l’hépatite D,
entérovirus, virus de la grippe, virus respiratoire syncytial, virus de
oreillons, virus de la rougeole, virus de la rubéole, parvovirus B19,
rotavirus, rétrovirus humains.
Pour chacun des virus suivants, connaître
les principaux caractères virologiques, les bases épidémiologiques, le pouvoir
pathogène et la prophylaxie éventuelle : rhinovirus, virus parainfluenza,
coronavirus, calicivirus, astrovirus, papillomavirus, polyomavirus, virus de la
rage, arbovirus.
D. Dans la mise en œuvre des examens biologiques nécessaires aux diagnostics des hépatites virales, des infections virales cutanéo-muqueuses et génitales, des infections virales transmises de la mère à l’enfant, des infections virales respiratoires, de la sphère ORL et de l’œil, des gastro-entérites virales, des infections virales et à ATNC du système nerveux et des infections à retrovirus humains, connaître en particulier :
§
le contrôle
de la prescription
§
la pratique
de la technique
§
la gestion
des erreurs techniques
§
la
validation biologique
§
la
validation médicale
§
l'assurance
qualité (GBEA, nomenclature)
§
les risques
professionnels et aspects médico-légaux
(Idem
Module bactériologie)
ã
Module Hygiène
A Approfondir les connaissances acquises au cours du second cycle et nécessaires à la compréhension de la prévention et de la surveillance des infections nosocomiales, notamment :
§
les risques
infectieux à l'égard du malade et du personnel
§
les mesures
d'hygiène de base et spécifiques
§
l'antisepsie,
désinfection et stérilisation
§
la place de
l'environnement dans la survenue d'infections nosocomiales
§
le rôle du
laboratoire dans l'alerte, la surveillance et l'investigation de cas groupés
d'infections nosocomiales et communautaires
B. Connaître la conduite à
tenir devant plusieurs types de situations infectieuses :
§
épidémie
d'infections nosocomiales ou communautaires
§
cas
d'exposition au sang
§
élimination
des déchets d'activités de soins
C. Connaître les mesures de
sécurité en vigueur concernant :
§
les
produits sanguins
§
les greffes
d'organes, tissus ou cellules
§
les
laboratoires et leur démarche qualité
§
le
transport d'échantillons biologiques
Biochimie
A l'issue de sa
formation de biochimie, le futur biologiste doit connaître les mécanismes
biochimiques impliqués en physiopathologie humaine. Il doit être apte à
expertiser les prescriptions d'actes de biochimie quant à leur pertinence, et
les résultats des analyses, tests et explorations, quant à leur cohérence avec
les processus métaboliques explorés. Il doit avoir acquis les notions
méthodologiques et le sens critique indispensables à la réalisation et à
l'interprétation des analyses de biochimie, en connaissant en particulier les
causes d'erreur pré-analytiques, analytiques, et post-analytiques spécifiques à
cette spécialité. Il doit savoir réaliser les gestes de prélèvements relatifs
aux examens de biochimie (prélèvements sanguins veineux, capillaires et
artériels, prélèvements chez l'enfant, prélèvements urinaires).
1 - Définition
des objectifs
A.
Formation dans le domaine de la physiopathologie et de l’interprétation des
examens
§
Apprendre aux
internes à utiliser les résultats des analyses et tests biochimiques en vue de
fournir une aide au diagnostic, au pronostic et au suivi thérapeutique, en
particulier en utilisant des arbres décisionnels établis à partir des
conférences de consensus et des données actualisées de la littérature.
§
Former les
internes à apprécier les critères d’évaluation des marqueurs biochimiques et à
être l'interlocuteur des cliniciens prescripteurs dans les démarches
diagnostiques et thérapeutiques pour l’exploration des pathologies du
métabolisme biochimique.
B.
Formation dans le domaine analytique et méthodologique
§ Donner aux internes une formation adaptée à l’exercice professionnel en leur fournissant les éléments nécessaires pour choisir, adapter, installer et exploiter des systèmes analytiques dans des conditions optimales.
2 - Moyens
La formation doit être acquise principalement en secteur hospitalier par un enseignement intégré, avec un apport complémentaire adapté de bases théoriques universitaires. Il est important qu’elle fasse appel à un travail personnel de l’interne, qui devra participer directement à des séances de formation au sein des services (exposés sur les différents thèmes, présentations et commentaires de dossiers clinico-biologiques), et assister à des séances d’enseignement universitaires ou post universitaires, et/ou à des présentations dans des colloques.
3 - Principaux champs
d’application
A.
Domaine de la physiopathologie et de l'interprétation des examens
L'interne devra savoir décrire la
stratégie des examens à effectuer et indiquer pour chaque examen l'intérêt
diagnostique, pronostique et/ou thérapeutique dans les situations suivantes. Il
devra en particulier être capable de maîtriser le degré d'urgence d'une
prescription d'analyses biologiques, et connaître les règles d'éthiques
indispensables à la prise en charge des patients.
§
sujets en
réanimation, perturbations électrolytiques et acido-basiques
§
syndromes
inflammatoires
§
pathologies
osseuses et rhumatismales
§
pathologies
oncologiques
§
facteurs de
risque et pathologies cardiovasculaires
§
pathologies
hépatiques et gastroentérologiques
§
troubles de
la nutrition et diabète, pathologies métaboliques et endocriniennes
§
pathologies
néphro-urinaires
§
reproduction
et grossesse
§
pathologies
du vieillissement, pathologies neurodégénératives
§
pathologies
pédiatriques et principales maladies génétiques ; dépistage, diagnostic et
suivi, aspects éthiques et juridiques
§
suivi
toxicologique, retentissement métabolique et pathologies provoqués par les
intoxications les plus fréquemment observées (alcool, oxyde de carbone, etc.)
B.
Domaine analytique et méthodologique
L'interne devra connaître
le principe et avoir la maîtrise des méthodes et principes généraux suivants,
en appliquant les règles du Guide de Bonne Exécution des Analyses de Biologie
Médicale :
§ phase préanalytique en biochimie :
contraintes spécifiques à aux analyses biologiques de la spécialité,
§
principales
méthodes de mesures (notamment optiques, électrochimiques,
spectrométriques),
§
principales
techniques séparatives (notamment chromatographiques, électrophorétiques),
§
principales
techniques de dosages et l’utilisation des procédés de reconnaissance
(notamment chimiques, enzymatiques et immunologiques),
§
application
de ces principes à des systèmes analytiques automatisés,
§
techniques
de base en Biologie moléculaire (notamment techniques d'extraction des acides
nucléiques, PCR, stratégie d'analyse de gènes),
§
outils de
l’assurance de qualité en biochimie :
Ø
choix d’un
système analytique et validation de techniques
Ø
maîtrise
des instruments et des systèmes analytiques
Ø